糖组学分析
Glycomics analysis
黏蛋白O糖组学分析
黏蛋白(mucin)是一种含有大量糖基的蛋白质,其中的糖基通常以O-糖的形式存在。黏蛋白O糖谱分析主要是通过对黏蛋白样本进行酶解、色谱分离和质谱分析等技术手段,来解析黏蛋白中O-糖的种类、结构和相对丰度。在生物医学研究、食品科学、生物技术等领域中有广泛的应用,可以为疾病诊断、药物研发、食品安全等方面提供重要信息。
实验流程
样本收集 — 蛋白提取 — 还原性β消解 — SEP柱脱盐纯化 — 过甲基化修饰 — MALDI-TOF MS / LC MS/MS 质谱分析 — 数据处理
样本形式
| 样本类型 | 蛋白样品 | 植物组织 | 动物组织 |
| 样品量 | 1mg | 500 mg | 500mg |
注:样品收集完成后液氮速冻5-10min,-80℃冰箱保存,独立密封干冰运输。
实验设备
赛默飞Orbitrap Exploris 480 高分辨质谱仪、布鲁克Autoflex Speed MALDI-TOF/TOF MS
应用方向
• 医学研究:通过分析黏蛋白中O-糖的组成和结构,可以揭示疾病发生过程中黏膜黏蛋白的变化,为疾病的早期诊断和治疗提供重要信息。
• 食品科学:通过O糖谱分析可以了解食品中黏蛋白的组成和结构特征,指导食品加工和质量监控。
• 药物研发:通过评估药物对蛋白质糖基化的影响,优化药物设计和研发过程,设计更有效的药物靶点,提高药物的疗效。
报告结果
• 具体实验流程
• 相关质谱参数
• 上机图谱
• 原始数据
• O-糖分析结果
• 生信分析结果
参考文献
1.Takagi J, Aoki K, Turner BS, et al. Mucin O-glycans are natural inhibitors of Candida albicans pathogenicity. Nat Chem Biol. 2022;18(7):762-773.2. Exploration of quantitative site-specific serum O-glycoproteomics with isobaric labelling for the discovery of putative O-glycoprotein biomarkers. Proteomics-Clinical Applications, 2022, prca.202100095.
3. Werlang CA, Chen WG, Aoki K, et al. Mucin O-glycans suppress quorum-sensing pathways and genetic transformation in Streptococcus mutans. Nat Microbiol. 2021;6(5):574-583.
4. Jua Lee et al, Spatial and temporal diversity of glycome expression in mammalian brain, Proc Natl Acad Sci U S A, 2020, 117: 28743-28753.
5. Exploring regulation of protein o-glycosylation in isogenic human hek293 cells by differential o-glycoproteomics. Molecular & Cellular Proteomics, 2019, 18, 1396-1409.
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