糖组结构表征
Characterization of Glycon structure
糖基化位点及糖型分析
糖基化位点及糖型分析是蛋白质翻译后修饰研究中的重要内容,主要涉及N-糖基化和O-糖基化两种类型。糖基化位点是指蛋白质链上连接糖链的特定氨基酸残基位置。N-糖基化位点通常位于天冬酰胺(Asn)残基上,其序列模式为Asn-X-Ser/Thr(X可以是除脯氨酸外的任何氨基酸)。O-糖基化位点则位于丝氨酸(Ser)或苏氨酸(Thr)残基上。糖型分析是指识别和区分不同糖链结构的过程。由于糖链的生物合成没有模板,同一个糖基化位点上可能会连接不同的糖链,导致所谓的“微观不均一性。
实验流程
糖蛋白样品— 多步酶解 — 糖肽富集 — 液相色谱串联质谱LC-MS/MS分析— 数据分析
样本形式
纯化蛋白样品,-80℃冰箱保存,独立密封干冰运输。
实验设备
赛默飞Orbitrap Exploris 480 高分辨质谱仪、赛默飞 Orbitrap Fusion Tribrid 质谱仪
应用方向
• 药物研发:在抗体药物开发中,糖基化修饰对药物的免疫原性和药代动力学特性有重要影响。通过分析糖基化位点和糖型,可以优化药物的设计和制造过程,提高药物的疗效和安全性。
• 疾病研究:通过分析蛋白质中的N-糖基化位点来探索与各种疾病相关的蛋白质修饰模式。这有助于揭示疾病发生发展的分子机制,并为疾病的诊断、治疗和预防提供新的线索。
测试报告
• 具体实验流程
• 相关质谱参数
• 质谱图片
• 原始数据
• 总糖型分析列表
• 糖基化位点分析列表
• 糖基化位点糖型统计
参考文献
1. Serum N-glycomics of a novel CDG-IIb patient reveals aberrant IgG glycosylation. Glycobiology, 2022, 32, 380-390.
2. Rapid antibody glycoengineering in CHO cells via RNA interference and CGE-LIF N-glycomics. Methods in Molecular Biology, 2022, 2370, 147-167.
3. Mads Delbo Larsen et al, Afucosylated IgG characterizes enveloped viral responses and correlates with COVID-19 severity, Science, 2021, 371:eabc8378.
4. Plasma membrane N-glycoproteome analysis of wheat seedling leaves under drought stress. International Journal of Biological Macromolecules, 2021, 193, 541-1550.
5. Systems-wide analysis of glycoprotein conformational changes by limited deglycosylation assay. Journal of Proteomics, 2021, 248, 104355.
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