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糖组结构表征

Characterization of Glycon structure

糖基化位点及糖型分析


     糖基化位点及糖型分析‌是蛋白质翻译后修饰研究中的重要内容,主要涉及N-糖基化和O-糖基化两种类型。糖基化位点是指蛋白质链上连接糖链的特定氨基酸残基位置。N-糖基化位点通常位于天冬酰胺(Asn)残基上,其序列模式为Asn-X-Ser/Thr(X可以是除脯氨酸外的任何氨基酸)。O-糖基化位点则位于丝氨酸(Ser)或苏氨酸(Thr)残基上‌。糖型分析是指识别和区分不同糖链结构的过程。由于糖链的生物合成没有模板,同一个糖基化位点上可能会连接不同的糖链,导致所谓的“微观不均一性。

实验流程

糖蛋白样品多步酶解 — 糖肽富集 液相色谱串联质谱LC-MS/MS分析— 数据分析

样本形式

纯化蛋白样品-80℃冰箱保存,独立密封干冰运输

实验设备

赛默飞Orbitrap Exploris 480 高分辨质谱仪、赛默飞 Orbitrap Fusion Tribrid 质谱仪

应用方向

• 药物研发:在抗体药物开发中,糖基化修饰对药物的免疫原性和药代动力学特性有重要影响。通过分析糖基化位点和糖型,可以优化药物的设计和制造过程,提高药物的疗效和安全性‌。

• 疾病研究:通过分析蛋白质中的N-糖基化位点来探索与各种疾病相关的蛋白质修饰模式。这有助于揭示疾病发生发展的分子机制,并为疾病的诊断、治疗和预防提供新的线索。

测试报告

• 具体实验流程

• 相关质谱参数

• 质谱图片

• 原始数据

总糖型分析列表

糖基化位点分析列表

• 糖基化位点糖型统计

参考文献

1. Serum N-glycomics of a novel CDG-IIb patient reveals aberrant IgG glycosylation. Glycobiology, 2022, 32, 380-390.

2. Rapid antibody glycoengineering in CHO cells via RNA interference and CGE-LIF N-glycomics. Methods in Molecular Biology, 2022, 2370, 147-167.

3. Mads Delbo Larsen et al, Afucosylated IgG characterizes enveloped viral responses and correlates with COVID-19 severity, Science, 2021, 371:eabc8378.

4. Plasma membrane N-glycoproteome analysis of wheat seedling leaves under drought stress. International Journal of Biological Macromolecules, 2021, 193, 541-1550.

5. Systems-wide analysis of glycoprotein conformational changes by limited deglycosylation assay. Journal of Proteomics, 2021, 248, 104355.


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