糖组结构表征
Characterization of Glycon structure
N糖谱分析
N-糖基化修饰是最常见的翻译后修饰(PTM),仅有一个核心五糖结构,可以影响蛋白质的稳定性、活性和定位等功能。通过N-糖组学分析可以帮助研究人员了解蛋白质的糖基化修饰类型、位置和数量,从而揭示其在生物学过程中的作用和调控机制。这种分析方法在研究糖蛋白、糖蛋白相互作用、疾病诊断和治疗等领域具有重要应用价值。
实验流程
糖蛋白样品 — PNGaseF去糖基化 — 过甲基化修饰 — MALDI-TOF MS质谱分析 / LC-MS/MS 质谱分析 — 数据处理
样本形式
纯化蛋白或富集后多肽,-80℃冰箱保存,独立密封干冰运输。
实验设备
赛默飞Orbitrap Exploris 480 高分辨质谱仪、布鲁克Autoflex Speed MALDI-TOF/TOF MS。
应用方向
• 糖蛋白研究:揭示蛋白质上N-糖的结构、数量和修饰类型,了解糖蛋白的功能、稳定性和相互作用。
• 疾病诊断与治疗:发现疾病相关的糖基化修饰模式,为疾病的诊断和治疗提供新的靶点和策略。
• 药物研发:评估药物对蛋白质糖基化的影响,优化药物设计和研发过程。
测试报告
• 具体实验流程
• 相关质谱参数
• 质谱图片
• 原始数据
• N-糖分析结果
参考文献
1. Serum N-glycomics of a novel CDG-IIb patient reveals aberrant IgG glycosylation. Glycobiology, 2022, 32, 380-390.
2. Rapid antibody glycoengineering in CHO cells via RNA interference and CGE-LIF N-glycomics. Methods in Molecular Biology, 2022, 2370, 147-167.
3. Mads Delbo Larsen et al, Afucosylated IgG characterizes enveloped viral responses and correlates with COVID-19 severity, Science, 2021, 371:eabc8378.
4. Kai-Ting C Shade et al, Sialylation of immunoglobulin E is a determinant of allergic pathogenicity, Nature, 2020, 582: 265-270.
5. Si Liu et al, A comprehensive analysis of subclass-specific IgG glycosylation in colorectal cancer progression by nanoLC-MS/MS, Analyst, 2020,145: 3136-3147.
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