糖组结构表征
Characterization of Glycon structure
O糖谱分析
O-糖基化也是一种常见的蛋白质翻译后修饰(PTM)方式,与单个修饰的N-糖基化不同的是O-糖基化通常是以基团为单位进行修饰的,具有8个核心结构及4个额外的拓展核心结构,结构更加复杂,分析难度更大。O-糖基化通过糖转移酶将末端单糖残基与丝氨酸或苏氨酸的OH基之间的糖苷键与多肽进行连接,形成糖基化修饰。O-糖基化修饰对蛋白质的稳定性、功能和相互作用具有重要影响。
实验流程
糖蛋白样品 — PNGaseF去糖基化 — 还原性β消解 — 过甲基化修饰 — MALDI-TOF MS/LC-MS/MS质谱分析 — 数据处理
样本形式
纯化蛋白或富集后多肽,-80℃冰箱保存,独立密封干冰运输。
实验设备
布鲁克Autoflex Speed MALDI-TOF/TOF MS、赛默飞Orbitrap Exploris 480 高分辨质谱仪
应用方向
• 医学研究:通过分析不同疾病状态下细胞表面O-糖的变化,揭示疾病的发生机制,为疾病的诊断和治疗提供新的策略。
• 食品科学:通过分析食品中的O-糖组成,可以评估食品的品质和安全性,为食品加工和质量控制提供参考依据。
• 药物研发:通过评估药物对蛋白质糖基化的影响,优化药物设计和研发过程,设计更有效的药物靶点,提高药物的疗效。
测试报告
• 具体实验流程
• 相关质谱参数
• 质谱图片
• 原始数据
• O-糖分析结果
参考文献
1. Rapid antibody glycoengineering in CHO cells via RNA interference and CGE-LIF N-glycomics. Methods in Molecular Biology, 2022, 2370, 147-167.
2. Wang S, Chen C, Gadi MR, et al. Chemoenzymatic modular assembly of O-GalNAc glycans for functional glycomics. Nat Commun. 2021;12(1):3573.
3. Kai-Ting C Shade et al, Sialylation of immunoglobulin E is a determinant of allergic pathogenicity, Nature, 2020, 582: 265-270.
4. Jua Lee et al, Spatial and temporal diversity of glycome expression in mammalian brain, Proc Natl Acad Sci U S A, 2020, 117: 28743-28753.
5. Exploring regulation of protein o-glycosylation in isogenic human hek293 cells by differential o-glycoproteomics. Molecular & Cellular Proteomics, 2019, 18, 1396-1409.
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