糖组学分析

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糖组学分析

N-糖组学分析

N-糖组学分析是一种用于研究生物体内N-糖结构和功能的分析方法。N-糖基化修饰是最常见的翻译后修饰（PTM），仅有一个核心五糖结构，可以影响蛋白质的稳定性、活性和定位等功能。通过N-糖组学分析可以帮助研究人员了解蛋白质的糖基化修饰类型、位置和数量，从而揭示其在生物学过程中的作用和调控机制。这种分析方法在研究糖蛋白、糖蛋白相互作用、疾病诊断和治疗等领域具有重要应用价值。

实验流程

样本收集 — 蛋白提取 — PNGaseF去糖基化— SPE柱脱盐纯化 — 过甲基化修饰 — MALDI-TOF MS / LC MS/MS 质谱分析 — 数据分析

样本形式

样本类型	蛋白	血清	细胞系	植物组织	动物组织	尿液
样品量	1mg	500 µL	1*10⁷	500 mg	500mg	2 mL

注：样品收集完成后液氮速冻5-10min，-80℃冰箱保存，独立密封干冰运输。

实验设备

赛默飞Orbitrap Exploris 480 高分辨质谱仪、布鲁克Autoflex Speed MALDI-TOF/TOF MS

应用方向

• 糖蛋白研究：揭示蛋白质上N-糖的结构、数量和修饰类型，了解糖蛋白的功能、稳定性和相互作用。
• 疾病诊断与治疗：发现疾病相关的糖基化修饰模式，为疾病的诊断和治疗提供新的靶点和策略。

• 药物研发：评估药物对蛋白质糖基化的影响，优化药物设计和研发过程。

报告结果

• 具体实验流程

• 相关质谱参数

• 上机图谱

• 原始数据

• N-糖分析结果

• 生信分析结果

参考文献

1. Serum N-glycomics of a novel CDG-IIb patient reveals aberrant IgG glycosylation. Glycobiology， 2022, 32, 380-390.

2. Rapid antibody glycoengineering in CHO cells via RNA interference and CGE-LIF N-glycomics. Methods in Molecular Biology, 2022, 2370, 147-167.

3. Mads Delbo Larsen et al, Afucosylated IgG characterizes enveloped viral responses and correlates with COVID-19 severity, Science, 2021, 371:eabc8378.

4. Kai-Ting C Shade et al, Sialylation of immunoglobulin E is a determinant of allergic pathogenicity, Nature, 2020, 582: 265-270.

5. Si Liu et al, A comprehensive analysis of subclass-specific IgG glycosylation in colorectal cancer progression by nanoLC-MS/MS, Analyst, 2020,145: 3136-3147.