糖组学分析

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糖组学分析

O-糖组学分析

O-糖基化也是一种常见的蛋白质翻译后修饰（PTM）方式，与单个修饰的N-糖基化不同的是O-糖基化通常是以基团为单位进行修饰的，具有8个核心结构及4个额外的拓展核心结构，结构更加复杂，分析难度更大。O-糖基化通过糖转移酶将末端单糖残基与丝氨酸或苏氨酸的OH基之间的糖苷键与多肽进行连接，形成糖基化修饰。O-糖基化修饰对蛋白质的稳定性、功能和相互作用具有重要影响。

实验流程

样本收集 — 蛋白提取 — PNGaseF去糖基化 — 还原性β消解 — SEP柱脱盐纯化 — 过甲基化修饰 — MALDI-TOF MS / LC MS/MS 质谱分析 — 数据处理

样本形式

样本类型	蛋白	血清	细胞系	植物组织	动物组织	尿液
样品量	1mg	500 µL	1*10⁷	500 mg	500mg	2 mL

注：样品收集完成后液氮速冻5-10min，-80℃冰箱保存，独立密封干冰运输。

实验设备

赛默飞Orbitrap Exploris 480 高分辨质谱仪、布鲁克Autoflex Speed MALDI-TOF/TOF MS

应用方向

• 医学研究：通过分析不同疾病状态下细胞表面O-糖的变化，揭示疾病的发生机制，为疾病的诊断和治疗提供新的策略。

• 食品科学：通过分析食品中的O-糖组成，可以评估食品的品质和安全性，为食品加工和质量控制提供参考依据。

• 药物研发：通过评估药物对蛋白质糖基化的影响，优化药物设计和研发过程，设计更有效的药物靶点，提高药物的疗效。

报告结果

• 具体实验流程

• 相关质谱参数

• 上机图谱

• 原始数据

• O-糖分析结果

• 生信分析结果

参考文献

1. Rapid antibody glycoengineering in CHO cells via RNA interference and CGE-LIF N-glycomics. Methods in Molecular Biology, 2022, 2370, 147-167.

2. Wang S, Chen C, Gadi MR, et al. Chemoenzymatic modular assembly of O-GalNAc glycans for functional glycomics. Nat Commun. 2021;12(1):3573.

3. Kai-Ting C Shade et al, Sialylation of immunoglobulin E is a determinant of allergic pathogenicity, Nature, 2020, 582: 265-270.

4. Jua Lee et al, Spatial and temporal diversity of glycome expression in mammalian brain, Proc Natl Acad Sci U S A, 2020, 117: 28743-28753.

5. Exploring regulation of protein o-glycosylation in isogenic human hek293 cells by differential o-glycoproteomics. Molecular & Cellular Proteomics, 2019, 18, 1396-1409.