糖组学分析
Glycomics analysis
糖基化蛋白组学分析
糖蛋白组学分析是一种研究糖蛋白(Glycoprotein)的组成、结构和功能的综合性研究方法。糖蛋白是一类具有糖基修饰的蛋白质,糖基修饰对蛋白质的稳定性、活性、细胞识别和信号传导等起着重要作用。糖蛋白组学分析结合了蛋白质组学、糖基组学和生物信息学等技术手段,旨在全面解析糖蛋白的结构和功能,揭示糖蛋白在生物系统中的重要作用。通过结合多种技术手段对糖蛋白的组成、结构和功能进行全面研究,有助于深入理解糖蛋白在生物系统中的重要作用,为疾病诊断、治疗和药物开发提供科学依据。
实验流程
样本收集 — 蛋白提取 —蛋白酶解 — 糖肽富集 — LC-MS/MS 质谱分析 — 数据分析
样本形式
| 样本类型 | 蛋白 | 血清 | 细胞系 | 植物组织 | 动物组织 | 尿液 |
| 样品量 | 1mg | 500 µL | 1*107 | 500 mg | 500mg | 2 mL |
注:样品收集完成后液氮速冻5-10min,-80℃冰箱保存,独立密封干冰运输。
实验设备
赛默飞Orbitrap Exploris 480 高分辨质谱仪、赛默飞 Orbitrap Fusion Tribrid 质谱仪
应用方向
• 发现疾病相关的糖基化修饰模式,为疾病的诊断和治疗提供新的靶点和策略。
• 疾病发病机理、新的肿瘤标志物发现以及重要糖蛋白的功能研究
• 揭示蛋白质上糖基的结构、数量和修饰类型,了解糖蛋白的功能、稳定性和相互作用。
报告结果
• 具体实验流程
• 相关设备参数
• 样本上机图谱
• 原始数据
• 数据分析结果
• 生信分析结果
参考文献
1. Serum N-glycomics of a novel CDG-IIb patient reveals aberrant IgG glycosylation. Glycobiology, 2022, 32, 380-390.
2. Rapid antibody glycoengineering in CHO cells via RNA interference and CGE-LIF N-glycomics. Methods in Molecular Biology, 2022, 2370, 147-167.
3. Mads Delbo Larsen et al, Afucosylated IgG characterizes enveloped viral responses and correlates with COVID-19 severity, Science, 2021, 371:eabc8378.
4. Kai-Ting C Shade et al, Sialylation of immunoglobulin E is a determinant of allergic pathogenicity, Nature, 2020, 582: 265-270.
5. Si Liu et al, A comprehensive analysis of subclass-specific IgG glycosylation in colorectal cancer progression by nanoLC-MS/MS, Analyst, 2020,145: 3136-3147.
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