Label-free是通过比较质谱分析次数或质谱峰强度，分析不同来源样品蛋白的数量变化，认为肽段在质谱中被捕获检测的频率与其在混合物中的丰度成正相关。因此，Label-free定量不需要对比较样本做特定标记处理，只需要比较特定肽段/蛋白在不同样品间的色谱质谱响应信号便可得到样品间蛋白表达量的变化，通常用于分析大规模蛋白鉴定和定量时所产生的质谱数据。Label-free技术又可分为基于谱图数（Spectra Count，简称SC）和基于肽段母离子强度（或色谱离子流的峰面积即XIC）两种方法，后者更准确，使用更广泛。Label-free技术对液相色谱串联质谱的稳定性和重复性要求较高，但无需昂贵的同位素标签做标记。
Label-free定量蛋白组学分析流程
实验流程
技术特点
蛋白质不需要进行标记，所需样品总量少，耗费低。
对实验操作稳定性、重复性要求高，准确性较标记定量略低。
要求至少做三次技术重复或生物学重复。
应用领域及范围`
疾病标志物筛选、作用机制研究、植物抗逆研究、药物作用靶点研究、特殊功能蛋白质筛选、物种蛋白质草图构建。
适合大样本量的定量比较，对无法用标记定量实现的实验设计，用label-free技术。
样品要求
注：尿液样品需提供5mL以上的量。
真菌孢子类样品，送样量加倍。
血清、血浆、脑脊液等样品需去除高峰度蛋白。
植物花瓣、根、茎、果皮、果肉，以及动物含脂肪的组织送样量加倍。
蛋白缓冲液中不能含有SDS、NP40、Triton、X-100各类去污剂。
项目周期
