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蛋白质相互作用网络分析

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  STRING是收录多个物种预测的和实验验证的蛋白质-蛋白质互作的数据库,包括直接的物理互作和间接的功能相关。结合差异表达分析结果和数据库收录的互作关系对,构建差异表达蛋白互作网络。分析过程中将差异表达蛋白映射到STRING数据库中,获得差异蛋白的相互作用关系信息。由于STING数据库除了包含有实验数据、从PubMed摘要中文本挖掘的结果和综合其他数据库数据外,还有利用生物信息学的方法预测的结果,从搜索结果中筛选出综合打分大于0.4(Medium)的蛋白互作关系对,并采用合适的生物信息学分析软件对相互作用结果进行可视化。

 

从而观

蛋白质相互作用网络

 

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